これはサポートファイル形式が限られるのでブロックデバイス単位の同期というわけではない?
でも VeraCrypt や VM image 対応してるのいいな
qcow2 とかはまだ?

Supported file formats:
Crypto container (e.g. VeraCrypt)
Disc images (.iso /.img)
Audio (raw audio formats /.wav /.aiff)
images (.svg /.tiff /.bmp /.dng)
Video (raw video formats, e.g. uncompressed.avi)
Virtual Machine Images (.vdi /.ova /.img /RAW)
Microsoft PST files (emails, calendar entries, etc.)
text files
Tar Archives

"Welcome Delta Sync for ownCloud - ownCloud" https://owncloud.org/news/welcome-delta-sync-for-owncloud/